章竹君教授于1991年被国务院学位委员会批准为博士生导师。曾任南京大学等校兼职教授、美国新罕布什尔大学客座教授，国家自然科学基金化学部第四和第五届评议组成员、化学计量学及化学生物传感技术国家重点实验室学术委员会委员、教育部现代分析科学重点实验室学术委员会委员、中国化学会分析化学委员会委员。兼任《分析化学》、《分析试验室》等自然科学核心期刊编委。
长期从事分析化学的研究工作，其领域涉及分离科学、分子光谱学和生物传感器等。主要研究方向为化学发光和生物发光分析、光学生物传感器、抗癌细胞、毒细胞的细胞发光免疫分析、实时分析系统、纳米粒子传感器及其在癌细胞及病原微生物检测中的应用、微阵列传感器芯片、免疫芯片及芯片实验室的研究、生命信息及其传递的实时监测等。
曾先后主持国家自然科学基金重大项目子项目1项、重点项目1项、面上项目7项、国家“十五”重大专项课题2项、国家教育部重点项目3项。研究成果已获5项欧美发明专利，1项中国发明专利，有10项研究成果获部委或省级科技进步一等奖两次、二等奖五次和三等奖两次。在国内外期刊上发表学术论文521篇，其中在SCI源刊上发表论文259篇。独撰专著一部，合著专著七部。从1992至今连续七届被选为欧洲光纤化学和生物传感器委员会常设指导委员会委员。1985年被评选为陕西省优秀教师，1998年被评选为全国优秀教师。
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